Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3415J3QMS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3415J3QMS8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3415J3QMS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3415J3QMS8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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