Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3336J3QMQ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3336J3QMQ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3336J3QMQ6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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