Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28051J3QMA2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28051J3QMA2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28051J3QMA2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28051J3QMA2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms