Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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