Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r194J3JS27 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r194J3JS27 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms