Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4lG5E8X2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms