Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E230025N22RikG5E8S3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E230025N22RikG5E8S3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E230025N22RikG5E8S3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E230025N22RikG5E8S3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms