Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r58G3X9U3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms