Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Arfgef1G3X9K3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arfgef1G3X9K3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Arfgef1G3X9K3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Arfgef1G3X9K3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arfgef1G3X9K3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms