Protein–RNA interactions for Protein: G3UXR8

Gm20532, Predicted gene 20532, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20532G3UXR8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20532G3UXR8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20532G3UXR8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20532G3UXR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20532G3UXR8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms