Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx1-1G3UXB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx1-1G3UXB3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-1G3UXB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms