Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdh9F8VPK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh9F8VPK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms