Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rfx7F8VPJ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rfx7F8VPJ6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rfx7F8VPJ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rfx7F8VPJ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rfx7F8VPJ6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rfx7F8VPJ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms