Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402N22RikF7D1B3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933402N22RikF7D1B3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402N22RikF7D1B3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4933402N22RikF7D1B3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms