Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M1F7CXU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M1F7CXU4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154 ms