Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igkv1-99F6XWB2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igkv1-99F6XWB2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-99F6XWB2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms