Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm21977F6U3N7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21977F6U3N7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm21977F6U3N7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm21977F6U3N7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm21977F6U3N7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21977F6U3N7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21977F6U3N7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms