Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms