Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1iE9Q7P2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1iE9Q7P2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1iE9Q7P2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1iE9Q7P2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms