Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f2E9Q366 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f2E9Q366 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Speer4f2E9Q366 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f2E9Q366 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Speer4f2E9Q366 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms