Protein–RNA interactions for Protein: E9Q280

Vmn2r18, Vomeronasal 2, receptor 18, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r18E9Q280 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn2r18E9Q280 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r18E9Q280 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn2r18E9Q280 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r18E9Q280 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms