Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt90E9Q1Z0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt90E9Q1Z0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt90E9Q1Z0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt90E9Q1Z0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms