Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pcdh10E9PXQ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pcdh10E9PXQ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pcdh10E9PXQ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pcdh10E9PXQ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pcdh10E9PXQ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pcdh10E9PXQ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms