Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4931408C20RikE9PWP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4931408C20RikE9PWP9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
4931408C20RikE9PWP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.55■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.55■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4931408C20RikE9PWP9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4931408C20RikE9PWP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms