Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc144bE9PVZ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms