Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Piezo1E2JF22 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Piezo1E2JF22 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Piezo1E2JF22 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Piezo1E2JF22 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms