Protein–RNA interactions for Protein: D3Z347

Slx, Sycp3-like X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlxD3Z347 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlxD3Z347 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SlxD3Z347 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SlxD3Z347 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlxD3Z347 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlxD3Z347 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms