Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SafbD3YXK2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SafbD3YXK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SafbD3YXK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SafbD3YXK2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms