Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc13D3YV10 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc13D3YV10 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms