Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrr3B2RXA8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrr3B2RXA8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrr3B2RXA8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrr3B2RXA8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms