Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BC035947B2RQY6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BC035947B2RQY6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BC035947B2RQY6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.6 ms