Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms