Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trabd2bB1ATG9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trabd2bB1ATG9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trabd2bB1ATG9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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