Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD6

Slfn9, Schlafen 9, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn9B1ARD6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn9B1ARD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn9B1ARD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn9B1ARD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn9B1ARD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn9B1ARD6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn9B1ARD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn9B1ARD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn9B1ARD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn9B1ARD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms