Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4dA7KBS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zscan4dA7KBS4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zscan4dA7KBS4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zscan4dA7KBS4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms