Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samt1A2BED8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samt1A2BED8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samt1A2BED8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms