Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl41A2AUC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl41A2AUC9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl41A2AUC9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl41A2AUC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms