Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Upf2A2AT37 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Upf2A2AT37 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Upf2A2AT37 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Upf2A2AT37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Upf2A2AT37 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms