Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pramef25A2ASI9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef25A2ASI9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef25A2ASI9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef25A2ASI9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms