Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn3aA2ASI5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scn3aA2ASI5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn3aA2ASI5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn3aA2ASI5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn3aA2ASI5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms