Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a11A2AJN7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc4a11A2AJN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc4a11A2AJN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms