Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms