Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pramel3A2AHA7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel3A2AHA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel3A2AHA7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms