Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930447F04RikA2AFR2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.7 ms