Protein–RNA interactions for Protein: A2A9U8

Cela3a, Chymotrypsin-like elastase family, member 3A, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cela3aA2A9U8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cela3aA2A9U8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cela3aA2A9U8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cela3aA2A9U8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cela3aA2A9U8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cela3aA2A9U8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cela3aA2A9U8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cela3aA2A9U8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cela3aA2A9U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms