Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l1A2A259 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2l1A2A259 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2l1A2A259 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms