Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cc2d2bA0A286YDU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cc2d2bA0A286YDU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Cc2d2bA0A286YDU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms