Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms