Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms