Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms