Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28360A0A087WR25 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28360A0A087WR25 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm28360A0A087WR25 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28360A0A087WR25 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.9 ms